המנהיגות הירוקה הינה חלק מתוכנית ארצית שמטרתה לקדם את תחום הקיימות בבית הספר ובקהילה. עיריית נתניה בחרה לקדם נושא זה בבתי הספר בעיר.
הפעילות נעשית בליווי מדריכי "הרשת הירוקה". ילדי המנהיגות לוקחים חלק בפרוייקטים עירוניים לקידום נושא הקיימות ונפגשים עם קבוצות מנהיגות נוספות בעיר לפעילויות שונות.
המנהיגות ירוקה בבית הספר היא גוף נבחר של תלמידים מכיתות ה-ו המעוניינים ומחוייבים להוביל תהליכי שינוי בבית הספר תוך עידוד אורח חיים ידידותי לסביבה. חברי המנהיגות הירוקה לומדים ופועלים למען בית הספר והקהילה.
תחומי הפעילות של המנהיגות הירוקה מתחלקים לעידוד אורח חיים סביבתי בתחומים שונים: חיסכון במשאבים: חיסכון במים, התייעלות אנרגית (חיסכון באנרגיה וחשמל), הפחתה והפרדה של פסולת וכן שמירה על סביבה נקייה ומטופחת וטיפוח טבע עירוני.
העברת המסרים הירוקים לכלל תלמידי בית הספר נעשית באמצעות טקסים, פרסום ושיווק, שילוט, ארגון ימי שיא והפסקות פעילות, הסברה בכיתות ועוד.